Težave in problemi, ki jih prinaša optimizacija spletnih strani prihajajo iz različnih koncev. V največ primerih so SEO težave povezane z vsebinskimi težavami glede pripravljanja SEO ustreznih spletnih vsebin, težave povezane s tem, da internetnih strani ne uspemo uvrstiti na višja mesta na Googlu, težave povezave s t.i. tehnično optimizacijo spletnih strani (npr. najrazličnejše nastavitve,…